Japans beste mangategnere skaper et nytt bilde av Batman og hans motstandere i denne banebrytende animefilmen. I Gotham City oppstår det en feil på Gorilla Grodds tidsmaskin, slik at en gjeng med skrullete skurker sendes tilbake i tid for å terrorisere middelalderens Japan. Kan Batman hindre den slu Jokeren og andre tyranner fra å skrive om historien?