Prinsen av Egypt er den utrolige historien om to brødre, den ene født av kongelig blod, den andre er foreldreløs med en skjult fortid. De vokser opp og blir de beste venner, knyttet sammen med sterke bånd av frisinnet ungdommelighet og sunn rivalisering. Men sannheten setter dem opp mot hverandre når den ene blir hersker over verdens mektigste imperium, og den andre blir valgt til leder for sitt folk. Den uungåelige konfrontasjonen mellom dem vil for alltid forandre deres live – og verden.