Etter 125 år i kryosøvn våkner våre helter opp til et nytt sted der de kan prøve igjen. Clarke og Bellamy leder en gruppe til denne mystiske verdenen, Sanctum, i håp om å kunne starte på nytt og finne fred. Men når de oppdager et idyllisk samfunn, viser det seg at ikke alt på Sanctum er like perfekt som det ser ut.